南京醫藥股份有限公司健康連鎖業務近年來以健康利益管理為主線，以消費者管理為核心，調整零售終端模式，積極打造標準化、專業化、模式化的門店經營模式，強化藥學服務與人文關懷，推動藥店經營從“以藥品為中心”的保障供應型向“以患者為中心”的技術服務型的全面轉型，逐步形成基于社區健康管理的標準化藥房（含方便診所）、專業化藥房（積極承接大型醫療機構門診藥房和社區衛生服務中心的藥事服務職能）、中醫中藥模式店、智慧健康園?，F有各類型門店324家、院內藥房6家、診所11家。主要覆蓋江蘇、安徽、福建三省，連續3年健康連鎖業務銷售規模位于中國藥品流通行業零售連鎖企業前20位。
       南京醫藥健康連鎖業務以藥學服務為核心，打造兩支隊伍，兩支隊伍即一支具有專業藥學知識的員工隊伍、一支穩定可靠的慢病患者隊伍。通過結合國外先進慢病管理運作經驗，重點開展慢病患者的管理與維護，提供集“慢病檢測+遠程監測+用藥指導+健康檔案管理”為一體的慢病管理服務，形成以消費者健康需求服務和健康利益管理為核心的“南京醫藥健康管理”品牌，推動零售藥店向健康服務型轉變。2016年，南京醫藥正式啟動了“慢病管理中心”項目，為零售終端藥學服務專業人員提供更加專業和系統的培訓，為慢病患者提供標準化的用藥指導和保健服務，提高處方藥在零售渠道的深度滲透。目前已在百信藥房、徐州廣濟、合肥大藥房先后開辟近43家藥學服務專區，由專業藥學服務人員依據社區居民的健康服務需求和“互聯網+”平臺，開展會員的開發與維護、基本體征數據檢測及健康檔案建立、用藥指導與消費分析、慢病干預與生活指導等，初步形成具有南京醫藥特色的健康管理服務模式。截止目前，會員銷售占比提升，客單價提升。
　　公司在江蘇省內企業共有執業藥師144人、醫藥及相關專業中高級職稱22人。